El informe describe que las violaciones contra la población civil se produjeron en razón del origen étnico o las simpatías políticas.
"Se reportan 114 casos de asesinatos cometidos por las fuerzas progubernamentales", dice el documento.
El país africano, que proclamó su independencia en 2011, vivió una guerra civil desde diciembre de 2013, cuando el presidente, Salva Kiir, acusó al exmandatario, Riek Machar, de haber organizado un golpe de Estado.
El conflicto enfrentó a los dos principales pueblos de Sudán del Sur —los dinka y los nuer— a los que pertenecen, respectivamente, Kiir y Machar.
Las hostilidades causaron más de dos millones de desplazados internos.
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En agosto de 2015 los bandos del conflicto lograron pactar la paz, sin embargo los enfrentamientos estallaron de nuevo hace menos de un año.