El sismo, que sacudió la región autónoma de Tashkurgan Tajik, dejó también 23 heridos.
Según el Centro Sismológico Nacional, el epicentro se situó a una profundidad de ocho kilómetros.
El terremoto se registró a las 5.58 de la mañana, hora local, y fue seguido por más de 80 réplicas.
Unas 6.200 personas residen en un radio de 50 kilómetros del epicentro, pero los informes preliminares apuntan a que el seísmo habría dejados unos 12.000 damnificados.
Las autoridades evacuaron a 9.200 personas de la zona en la que quedaron destruidas más de 1.500 instalaciones.